岛最近的清国领土之一，袁世凯打算以这里为基地，进攻澎湖岛。
袁世凯来到厦门，会合闽浙总兵周振邦，袁世凯听周振邦说金门岛上有华夏对外贸易总公司的人，立刻打算派出使者，登上金门岛，驱逐这些人。
周振邦建议将这些华夏人直接杀掉，袁世凯想到李鸿章“螳螂捕蝉黄雀在后”的话，断然拒绝，派出使者登岛，向岛上的华夏人下达了驱逐令。
华夏对外贸易总公司无力抵抗如此多的清兵，于是从金门岛撤出，返回澎湖岛，其实林飞本可以在金门岛经营建设，把这里打造成进攻清国的桥头堡，可是林飞并没有那样做，因为金门岛距离清廷腹地实在太近，这样做太刺激清廷了。
袁世凯在厦门进行了两天准备，在十二月七日这一天，挥师进攻澎湖岛。
袁世凯的手下有四支部队，八旗兵、绿营兵、勇营兵和新编陆军，这四支部队是清廷混乱军制的缩影，八旗兵是满清打天下的部队，这支部队曾经骁勇无敌，没有他们，满清就战胜不了明朝，不过在满清入关之后，八旗兵迅速腐化堕落，从一群凶悍无比的战士变成了只会提笼架鸟的纨绔公子。
到康熙平定三藩之乱的时候，八旗兵就已经完全不能用了，这时清廷大量启用汉人，组