华夏军随即占领了燕子矶，开始合围钟山，南京山、燕子矶和钟山，三处要地互为犄角，任何一处崩溃，都会危及到另外两处，此时南京城被华夏军掌控，燕子矶守将谢葆璋投降，钟山已然是一座孤山，刘坤一意识到钟山已经没有防御的价值了，率领部队从钟山撤出，一路向南溃退，进入湖南。
五月七日，南京战役正式结束，这一战以华夏帝国的大胜而告终，这场战役共分为三个部分，南京城之战、燕子矶之战和钟山之战，三个战场，共歼灭清军一万多人，俘虏十万多人，其余清兵全部逃散。
南京城被华夏攻占，整个东南区域就全都进入了林飞的掌握，虽然苏州、杭州、无锡等等重要城市还在清廷的控制下，可是这些城市已经是一座座孤城，被林飞攻破是早晚的事情。
南京失陷，更进一步刺激了西方列强，日本和俄国，德国和英国都想要媾和，共同对付华夏，而俄国，最先动手了。