为了执行幻想乡虚空航行计划，大妖怪们将博丽神社清空，所有闲杂人等都被结界禁止进入博丽神社。这就是为什么爱丽丝没有在神社庭院等待，而是在参拜兽道等待的原因。
从古至今，或者说从幻想乡建成以来，博丽神社一直都是幻想乡真正的中心地带。虽然从今天的地理环境上来看，博丽神社已经接近幻想乡东方的边缘，不过幻想乡内部的地理位置被调整过，再加上一些在幻想乡建成之后进入幻想乡的地域，博丽神社才会处在幻想乡东方的位置上。
现在，博丽神社中的结界被打开，博丽神社再次成为幻想乡的中心地带。在这里可以对整个幻想乡进行调整，也可以纵览整个幻想乡的情况。
现世的毁灭已经波及幻想乡，幻想乡的天空中已经出现虚空裂痕，这是世界即将崩溃的征兆。随着虚空的面貌展现在幻想乡众多大妖怪面前，一部分大妖怪们开始获得关于虚空的知识，这为她们的虚空航行计划提供了充足的理论依据。
曾经在创建幻想乡之前，紫就关于幻想乡有两个方案，其一是建成现在的幻想乡，其二则是虚空航行。让幻想乡脱离世界进入无边虚空，从而成长为新的世界。然而当是的紫也好，其他大妖怪也好，都没有关于虚空的知识，她们并不