蒙古人之所以能够征伐天下，其军制也有着不可忽视的巨大作用。
在蒙古帝国之中，实行部落兵制，一般而言，十五以上，七十以下的男丁，都得当兵，跨上马背便能战斗，下了马之后便从事牧畜甚至屯田。
蒙古帝国最为正统的自然是蒙古军，早先说过的探马赤军乃是蒙古军的精锐骑兵，至于汉军和新附军，则大多是步军。
不过随着蒙古帝国的疆域不断扩大，蒙古直系的兵源严重不足，他们只能吸纳比较忠诚的色目人和汉人精英，加入到探马赤军之中。
这些军队的编制也很简单，分为万户府，千户所、百户所以及牌子四个级别。
虽说是万户府，但实际上一个万户府也就只有三到七千人左右，千户所则是三到七百人，而牌子则指十户左右。
各级的首领也相应地授予万户、千户、百户和牌子头等统领头衔。
当然了，这些都是蒙古亲军的编制，在那些非蒙古军的万户府和千户所之中，又增设了达鲁花赤，其实就是监军，专由蒙古人或者色目人来担任。
至于万户府之上，有时候会设置都万户府或者大都督府，侍卫亲军则会在千户所上设置一个指挥使司，以此来加强军权的掌控和管理。