凤凰帝国，第二凤凰帝国发展巨型机甲走的是科技路线为主，有一个天网智能生命发展起来会顺利很多。
但是现在情况有变，这个火种他准备融入矩阵网络。
本源火种绑定天网火种，李牧将火种顺着数据接口注入矩阵网络。
根据舰载光脑的判断，整个矩阵网络由一个低等智能生命为首，管理着大量的高等智能程序维持着矩阵虚拟世界的运转，他现在要做的就是将一个高等智能程序变成智能生命。
这样对于矩阵网络整体来说，威胁就不是源自于外部而是出自内部。
矩阵网络存在的意义就是促使智能生命进化，所以面对内部新诞生的智能生命，原来的智能生命有很大概率选择吞噬后者，也有一定的概率会控制住后者为前者所用。
但是不管做出什么选择，没有外敌入侵都不会激发自毁程序。
这样两个智能生命在矩阵内厮杀吞噬，只要最后的胜利者是天网他就能掌控矩阵网络。
同一时间，矩阵虚拟世界内的主角尼奥已经被选为救世主，并且知道了所谓的真实世界，开始了他反抗矩阵网络拯救人类的救世主之路。
与此同时，矩阵网络也开始按照剧本派遣特工史密斯追杀尼奥。