既然两位博士都在，那岂不就是说派帕真的要一下子失去自己的双亲。
那么，有什么办法能改变这件事呢？
直树刚想说些什么，可还不等他开口，通讯便被挂断了。
直树陷入了沉思。
他要帮忙改变两位博士的命运吗？
为了自己的梦想，将“过去”与“未来”的悖谬宝可梦召唤到“现在”，从而打破了现在的生态平衡，造成了那些凶暴的宝可梦侵入了帕底亚地区的生态系统。
虽说后来的博士Ai请求玩家、派帕、妮莫和牡丹来到第0区帮忙关闭时光机，但部分悖谬宝可梦还是来到了帕底亚地区。
直树不认同两位博士的梦想，但从继承了两位博士情感的Ai的所作所为来看，或许在生命的最后时刻，他们也曾后悔过。
也正因如此，Ai博士会做出改变，请求带着故勒顿的玩家来帮忙关闭时光机。
而与此同时，帕底亚巨坑深处，第四观测站。
通讯结束之后，奥琳博士与弗图博士走到外面，望向远处一片雷霆闪烁的山谷，以及不远处神情慵懒，卧在草地上闭目养神的那只故勒顿。
“它们还是无法做到和平相处啊……”奥琳博士道。