上，在八月的时候袭击了厦门水师。
大明沿海的各个州府已经得到了朝廷的警告，警惕西洋荷兰人的入侵。但就是在这样早有准备的情况下，厦门还是被荷兰人成功登陆了。
因为大明水师的舰艇吨位是400多，主要是由商船和民船改建的。而荷兰纵横海洋的盖lun船，排水接近1000吨。还没来得及更换火pào的厦门水师，原来的火pàoshè程尚不到千米。
船小、火pàoshè程不够，这一战使厦门水师损失了十五艘战舰。登陆成功的荷兰人，向大明官府提出中断与其他国家的贸易，所有的进出口必须要通过荷兰人进行。
刚刚到福建的南居益，是以右副都御史的身份巡抚福建的。他在福州得知了荷兰人占领厦门港的消息后，一面详细地把厦门水师战败的具体细节写进八百里加急里，作为朝廷增援的依据，一面出面邀请荷兰人到福州商谈具体的贸易措施。
南居益出身名门，曾祖南从吉与曾伯祖南大吉皆进士。祖父南轩是嘉靖年间的进士、庶吉士，父亲南宪仲是万历二年的进士、枣强知县，可惜天不假年，未及擢用，突然病逝。南居益之后依靠家族长大，并在万历二十九年进士得中，历授刑部主事、广平知府后，擢山西提学副使