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太甲杀死伊尹的时间应为复位之后，其表面上感激伊尹的匡扶之功，其实早已怀恨在心，且君弱臣强的局面是不可能持续太久的。其只是在等待时机，直到复位成功一段时间之后，其处死了伊尹，收回了大权。但是由于伊尹的功劳太大了，无过被诛，出现天象大雾三日，说明百姓和臣民对其的缅怀，所以太甲不得不将伊尹的田地分封给他的两个儿子，以安抚朝臣和百姓。
伊尹死后葬于今河南虞城，现虞城西南魏堌堆有伊尹墓。伊尹生前写过许多文字，汉书录有伊尹五十一篇，伊尹说二十七篇，早佚。玉函山房辑佚书书有伊尹一卷。1973年，长沙马王堆三号汉墓出土帛书有伊尹零篇六十四行。
太甲十年，伊尹的灵位被以太牢之礼迎入太庙隆重祭祀。
古代帝王祭祀时，牛、羊、猪三牲全备为太牢；诸侯祭祀只备羊、猪，称少牢。所以有时太牢专指牛。天子除祭祀天地、社稷外，一些小的祭祀也可用少牢。
刚开始祭祀的时候，天地一片明亮，说明祭祀伊尹的行为得到神人同贺，也说明公道自在人心。
虽然伊尹被处死了，但是太甲的流放生涯并没有白废，体会了贫民百姓的生活，并没有改动之前行之有效地由伊尹建立的制度，